Перша частина кінострічки починається з того, що неподалік від Філіппін доктор Ісіро Серідзава в компанії своїх колег знаходять кістяк невідомого доісторичного ящера Годзілли. У печері вони також знайшли величезну діру і гігантські сліди, що вели в море. А тим часом...