За сюжетом другої частини "Скайлайна", в країні панує паніка і хаос. Над небом накопичилася величезна кількість дивних кораблів, в яких знаходилися інопланетні істоти. Через спеціальні, потужні промені вони викрадали на борт корабля людей з вулиць і будинків....